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　　早于1903年美因茨已尝试组织足球队，但以失败告终，两年后终于成功创立“1. Mainzer Fussballclub Hassia 1905”。在“德国南部联会联赛”（Süddeutschen Fußballverband）比赛一段时间后，球队与“Mainzer TV 1817”名为“FC Hermannia 07”的足球部合并组成“1. Mainzer Fussballverein Hassia 05”，于1912年8月从名字中删除“Hassia”。
　　第一次世界大战后的1919年，球队再与“Sportverein 1908 Mainz”合并组成“1. Mainzer Fußball- und Sportverein 05”，昵称“Die Nullfünfer”是具有争标实力的球队，在两次大战之间赢得多次地区联赛冠军，更于1921年晋级全国锦标赛的初赛圈。
　　于1920年代末到1930年代初，美因茨在“莱茵-黑森区级联赛”（Bezirksliga Main-Hessen ）的黑森赛区（Gruppe Hessen）获得不错的成绩，包括1932年及1933年两夺冠军。当纳粹德国重组联赛制度后，战绩辉煌的美因茨获编入16个顶级联赛中的“西南省际联赛”（Gauliga Südwest），但仅能维持一季即降级。1938年被迫与“Reichsbahn SV Mainz”合并，以“Reichsbahn SV Mainz 05”的名义继续比赛直到第二次世界大战完结。
　　战后美因茨再次参在顶级联赛的“西南州级联赛”（Oberliga Südwest）中角逐，但只属中游份子。当新的职业联赛德甲在1963年成立时，美因茨被置于第二级的地区联赛（Regionalliga），此后40年大部分时间在第二级联赛中打拼。由于财务困难于1970年代末到1980年代初降级到“西南业余州级联赛”（Amateur Oberliga Südwest (III)），于1982年夺得德国业余足球锦标赛冠军（Deutsche Amateurmeisterschaft）。
　　美因茨于1988年曾升级到职业的德乙一个球季，降级后于1990年再次返回德乙，最初美因茨被视为降级热门，每季需为护级而苦苦挣扎。在非正统的主教练沃尔夫冈·弗兰克（Wolfgang Frank）任教期间，美因茨成为少数采用平排四人防线的德国球队，有别于一般采用人钉人加清道夫的防守战术。
　　1997年、2002年及2003年获得3个升级名额之后的第四位而未能到顶级联赛中角逐，2002年获得64分而成为历来德乙得分最高而未能升级的球队；2003年更于最后一场比赛补时的93分钟才被否定升级的权利。但努力最终没有白费，于2004年在尤尔根·克洛普（Jürgen Klopp）带领下升级德甲，在顶级联赛中逗留三个球季。
　　美因茨于2004/05球季比赛成绩上有了很大的突破，经由欧洲足协的“公平竞技榜”而获得了参加欧洲足协杯的机会。